Beim SIBO kommt es zu einer pathologischen Anhäufung der physiologischen Dickdarmflora im Dünndarm. Normalerweise ist der Dünndarm nur spärlich mit Mikroorganismen besiedelt, typischerweise unter 10³ KBE/ml –, da mehrere Schutzmechanismen eine übermäßige mikrobielle Kolonisation verhindern. Zu diesen Barrieren zählen:
MERKBLATT: SIBO – Fehlbesiedlung des Dünndarms